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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210629359.X (22)申请日 2022.05.31 (66)本国优先权数据 202110628817.3 2021.0 6.02 CN (71)申请人 启愈生物技 术 (上海) 有限公司 地址 201203 上海市浦东 新区中国 (上海) 自由贸易试验区张衡路1227号、 哈雷 路1118号孵化楼第二层2 04室、 206室、 207室 (72)发明人 屈向东 潘琴  (51)Int.Cl. C07K 16/28(2006.01) C12N 15/13(2006.01) C12N 15/85(2006.01) C07K 16/46(2006.01)C07K 19/00(2006.01) C12N 15/62(2006.01) A61K 38/20(2006.01) A61K 39/395(2006.01) A61P 35/00(2006.01) A61P 35/02(2006.01) (54)发明名称 抗CD3抗体 变异体、 融合蛋白及应用 (57)摘要 本发明公开了抗CD3抗体变异体、 融合蛋白 及应用。 通过对抗CD3抗体进行突变获得其变异 体。 提供的融合蛋白包括: ( 1)抗肿瘤相关抗原 (TAA)/抗CD3双特异抗体; (2)抗肿瘤相关抗原 (TAA)、 抗CD3及含IL15/IL15Ra的多功能融合蛋 白; (3)抗肿瘤相关抗原(TAA)及含IL15/IL15Ra 的融合蛋白。 还提供了编码抗体分子的核酸分子 及载体, 以及抗体分子的制药用途。 权利要求书9页 说明书29页 序列表68页 附图17页 CN 115433282 A 2022.12.06 CN 115433282 A 1.一种抗CD3抗体变异体, 所述抗CD3抗体包括: 重链可变区和轻链可变区; 所述重链可 变区包括: VHCDR1、 VHCDR2、 VHCDR3; 所述轻链可变区包括: VLCDR1、 VLCDR2、 VLCDR3; 所述抗 CD3抗体的氨基酸序列包括SEQ  ID NO: 29‑34所示的VHCDR1、 VHCDR2、 VHCDR3、 VLCDR1、 VLCDR2和VLCDR3; 其特征在于: 所述抗CD3抗体变异体的突变位点包括以下任意1个或2个以 上位点: SEQ ID NO: 30所示序列的第十位 点, SEQ ID NO: 31所示序列的第二、 七位 点, SEQ ID NO: 33所示序列的第三、 四位 点, SEQ ID NO: 34所示序列的第四、 五、 六、 七位 点。 2.根据权利要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述的突变是指氨基酸被取 代。 3.根据权利要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 变异体的突变位点包括以下 任意1个或2个以上位 点: SEQ ID NO: 30所示序列中第十位的A被取代为E, SEQ ID NO: 31所示序列中第二 位的G被取代为S、 第七位的S被取代为G, SEQ ID NO: 33所示序列中第三 位的N被取代为 W、 第四位的K被取代为 L, SEQ ID NO: 34所示序列中第四位的Y被取代为N或R、 第五位的S被取代为K、 第六位 的N 被取代为G、 第七位的L被取代为G。 4.根据权利要求1所述的抗CD3抗体 变异体, 其特 征在于, VHCDR2的氨基酸序列如SEQ  ID NO:35所示; 或者, VHCDR3的氨基酸序列如SEQ  ID NO:36所示; 或者, VLCDR2的氨基酸序列如SEQ  ID NO:37或38所示; 或者, VLCDR3的氨基酸序列如SEQ  ID NO:39、 40或41所示。 5.根据权利要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述VHCDR1、 VHCDR2、 VHCDR3、 VLCDR1、 VLCDR2和VLCDR3的氨基酸序列如以下任意 一组序列所示: (1)SEQ ID NO: 29、 35、 31、 32、 37、 39; (2)SEQ ID NO: 29、 35、 36、 32、 37、 40; (3)SEQ ID NO: 29、 35、 36、 32、 38、 41。 6.根据权利要求5所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述抗体变异体的重链可变 区和/或轻链可变区选自SEQ  ID NO: 1、 2或3所示序列的重链可变区和/或轻链可变区, 或与 其具有至少90%序列同一 性。 7.根据权利要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述重链可变区和所述轻链 可变区之 间具有用于形成二硫键的突变, 所述突变的位点包括以下组合形式中的任意一种 或两种以上, 突变位 点根据EU编号, 所述重链可变区以VH表示, 所述轻链可变区以VL表示:权 利 要 求 书 1/9 页 2 CN 115433282 A 28.根据权利要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述抗CD3抗体变异体还包 含: 选自人源IgG1、 IgG2、 IgG3、 或IgG4或其变体的重链恒定区; 以及选自人源κ、 λ链或其变 体的轻链恒定区; 所述重链恒定区包 含: Fc片段或其变 体。 9.根据权利 要求1所述的抗CD3抗体变异体, 其特征在于, 所述抗体变异体为scFv, 其包 含重链可变区、 轻链可变区、 以及连接所述重链可变区和所述轻链可变区的连接片段, 所述 连接片段的氨基酸序列优选为若干个G GGGS重复, 更优选为3个G GGGS重复。 10.权利要求1至9中任意一项所述的抗CD3抗体变异体在制备用于抑制或治疗癌症的 药物中的应用。 11.根据权利要求10所述的应用, 其特征在于, 所述癌症选自 以下癌症或发生于以下部 位: 结直肠、 乳 腺、 卵巢、 胰腺、 胃、 前列腺、 肾、 宫颈、 骨髓癌、 淋巴癌、 白血病、 甲状腺、 子宫内 膜、 子宫、 膀胱、 神经内分泌、 头部颈部、 肝、 鼻咽、 睾丸、 小细胞肺癌、 非小细胞肺癌、 黑素瘤、 基底细胞皮肤癌、 鳞状细胞皮肤癌、 隆突性皮肤纤维肉瘤、 梅克尔细胞癌、 成胶质细胞瘤、 胶 质瘤、 肉瘤、 间皮瘤、 以及 骨髓增生异常综合症。 12.一种核酸分子, 其编码权利要求1至9中任意 一项所述的抗CD3抗体 变异体。 13.一种表达载体, 其包 含权利要求12所述的核酸分子 。 14.一种抗肿瘤相关抗原(TAA)/抗CD3的蛋白分子, 其特征在于, 其为异二聚体形式, 包 括第一单体和第二单体; 所述第一单体包括: (a)Fd片段; (b)轻链片段及第一Fc链; 所述第二单体包括: (a)Fd片段; (b)轻链片段、 抗CD3抗体片段以及第二Fc链; 所述轻链片段包括VL结构域和CL结构域; 所述Fd片段包括VH结构域和CH1结构域; 在 所 述第一单体或所述第二单体中, 所述轻链片段与所述Fd片段配对形成抗TAA的Fab结构域; 其中, 所述第一单体的轻链片段与所述第一Fc链融合; 所述抗CD3抗体片段的N端与所述第 二单体的轻链片段融合, C端与所述第二Fc链融合; 或者, 所述第一单体包括: (a)Fd片段; (b)轻链片段、 细胞因子功能 区、 第一Fc链; 所述第二单体包括: (a)Fd片段; (b)轻链片段、 抗CD3抗体片段、 以及第二Fc链; 所述细胞因子功能区包括IL ‑15及IL‑15Ra; 其中, 所述细胞因子功能区的N端与所述第 一单体的轻链片段融合, C端与所述第一Fc链融合; 所述抗CD 3抗体片段的N端与所述第二单 体的轻链片段融合, C端与所述第二Fc链融合;权 利 要 求 书 2/9 页 3 CN 115433282 A 3

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