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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210619622.7 (22)申请日 2022.06.02 (71)申请人 中国人民解 放军海军军医大学 地址 200433 上海市杨 浦区翔殷路80 0号 (72)发明人 蒋俊锋 王越 杨彦勇 陈媛媛  张莉 高福 韩超峰  (74)专利代理 机构 上海申浩 律师事务所 31280 专利代理师 赵青 (51)Int.Cl. A61K 48/00(2006.01) A61K 45/06(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 通过基因编辑技术联合DNA损伤 修复抑制剂 特异杀伤癌细胞的方法 (57)摘要 癌症对人类健康有着巨大的威胁, 目前没有 特别好的治疗 方法。 最主要的原因是尚未找到非 常好的特异杀伤癌细胞而对正常细胞影响较小 的方法。 DNA的断裂如果得不到修复会导致细胞 死亡, 这是放疗的基本原理, 但放疗也会导致正 常细胞中的DNA损伤。 本发明提出一种特异杀伤 癌细胞的方法, 利用基因编辑技术造成癌细胞特 有的DNA断裂(正 常细胞中没有 这些DNA切点), 同 时联合DNA损伤修复抑制剂, 抑制癌细胞中的DNA 修复, 导致癌细胞特异性死亡。 本发明为癌症的 精准治疗提供了新思路。 权利要求书1页 说明书12页 序列表6页 附图5页 CN 115227834 A 2022.10.25 CN 115227834 A 1.一种基因编辑系统和DNA损伤修复抑制剂联用 在制备治疗肿瘤药物中的应用, 所述 的基因编辑系统, 是针对癌细胞中特有的不同于正常细胞的DNA序列设计合成, 用以使癌细 胞中的特有DNA序列断裂或损伤。 2.根据权利要求1所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制剂联用 在制备治疗肿瘤药 物中的应用, 所述的特有DNA序列为癌细胞中特有的且能和正常细胞区分的DNA序列包括但 不限于点 突变、 插入突变、 缺失突变、 染色体易 位。 3.根据权利要求1或2所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制 剂联用在制备治疗肿瘤 药物中的应用, 所述的基因编辑系统为锌指核酸酶系统、 转录激活因子样效应子系统、 CRISPR基因编辑系统、 其 他能导致特异位 点DNA损伤的基因编辑系统。 4.根据权利要求3所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制剂联用 在制备治疗肿瘤药 物中的应用, 所述的基因编辑系统是直接合成的, 或是导入细胞后能被细胞生成有效编辑 系统的载体。 5.根据权利要求1或2所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制 剂联用在制备治疗肿瘤 药物中的应用, 所述的DNA损伤 修复抑制剂包括但不限于以下任一或两者组合: 非同源末端 连接途径的抑制剂、 同源重组途径的抑制剂。 6.根据权利要求1或2所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制 剂联用在制备治疗肿瘤 药物中的应用, 所述的治疗肿瘤药物, 其给 药方式为注射、 口服、 外 涂、 吸入。 7.根据权利要求1或2所述的基因编辑系统和DNA损伤修复抑制 剂联用在制备治疗肿瘤 药物中的应用, 所述的肿瘤 包括但不限于肝癌、 胃癌、 肠癌、 前列腺癌、 乳 腺肿瘤、 头颈肿瘤、 胶质母细胞瘤、 膀胱肿 瘤、 胰腺肿瘤、 卵巢肿瘤、 皮肤肿 瘤、 白血病、 淋巴瘤, 骨肉瘤, 纤维肉 瘤。 8.一种通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌细胞的方法, 包括以下 步骤: S1.确定癌细胞中特有的不同于正常细胞的至少一条DNA序列; S2.设计合成针对S1步骤确定的特有序列的基因编辑系统, 导入癌细胞使特有序列断 裂或损伤; S3.将DNA损伤修复抑制剂导入癌细胞。 9.根据权利要求8所述的通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌细胞 的方法, 所述的S1步骤中, 特有的DNA序列为癌细胞中特有的且 能和正常细胞区分 的DNA序 列包括但不限于点 突变、 插入突变、 缺失突变、 染色体易 位。 10.根据权利要求8或9所述的通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌 细胞的方法, 所述的S2 步骤中, 基因编辑系统是锌指核酸酶系统、 转录激活因子样效应子系 统、 CRISPR基因编辑系统、 其 他能导致特异位 点DNA损伤的基因编辑系统。 11.根据权利要求8或9所述的通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌 细胞的方法, 所述的S 3步骤中, DNA损伤修复的抑制剂包括但 不限于选自以下任一或两者组 合: 非同源末端连接途径的抑制剂、 同源重组途径的抑制剂。 12.根据权利要求8或9所述的通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌 细胞的方法, 所述的S2和S3步骤中, 导入癌细胞可以是同步, 也可以是分别导入, 导入方法 可以相同或不同。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115227834 A 2通过基因编辑技术联合DNA损伤修复抑制剂特异杀伤癌细胞 的方法 技术领域 [0001]本发明涉及生物技术及癌症治疗领域, 具体涉及一种特异性强, 能有效应对癌细 胞演进性和异质性问题的癌细胞 特异性杀伤方法, 以及相应的产品和应用。 背景技术 [0002]癌症是严重威胁人类生命的疾病,目前肿瘤的主要依靠包括手术, 化疗和放射等 治疗方式治疗, 目前极少癌症患者能被完全治愈。 手术的方式不能把所有的癌细胞都去除, 而放疗和化疗等其它肿瘤治疗方法都不能特异的只杀伤癌细胞, 因此找到不杀伤正常细胞 只杀伤癌细胞的方法可能对于肿瘤的治疗有重要意 义。 [0003]最近出现的基因编辑技术使得人们可以对细胞内的DNA的精准位点进行切割, 突 变, 修改, 插入, 替换等编辑, 有广阔的应用前景。 现有的基因编辑技术包括: 锌指核酸酶 (ZFN)、 转录 激活因子样效应子(TALEN)和规 律成簇的间隔短回文重复(CRIS PR)等。 [0004]例如CRISPR基因编辑技术, 发现于细菌的免疫机制。 CRISPR(clustered   regularly  interspaced  short palindromic  repeats)是存在于细菌基因组中的DNA序 列, 即成簇规律间隔短回文重复。 有多种类型的CRISPR相关基因(CRISPR  associated, Cas), Cas9是其中一种类型, 其表达产物是Cas9核酸内切酶。 以Cas9作为切割元件的CRISPR 基因编辑为例, 人们通过在细胞中导入Cas9和一条经过特殊设计的向导RNA(gRNA)实现快 速精准的对目标DNA的切割。 具体机制是gRNA通过碱基互补原理与目的DNA位点结合, 指导 Cas9蛋白定位于目的DNA位点, 并造成结合位置DNA在精准位点的断裂, 再利用细胞中本来 存在的DNA的损伤修复机制, 实现对DNA在断裂位点及附近进行突变, 插入, 替换等等修改, 实现基因编辑的目的。 发 明人也一直在研究CRISPR ‑Cas9基因编辑技术, 并在安全性方面对 改技术进行了优化, 并成功地在特定位点诱导染色体易位(参见专利文献: 刘厚奇、 蒋俊锋 等, 一种安全编码Cas9蛋 白的核酸分子及其表达载体, 专利号CN  201510092144.9, 授权公 告号CN104805099B; CRISPR ‑Cas9技术构建染色体易位干细胞及动物模型的方法专利号CN   201510075127.4, 授权公告号CN104726494B),我们 还发明了一种新的CRISPR方法, 通过非 同源DNA末端连接(NHEJ)插入终止子, 从而有效地敲除前列腺癌细胞中重要的LncRNA(参见 专利文献: 蒋俊锋等, 一种利用基因编辑技术敲入终止子实现可转录元件敲除的方法, 专利 申请号CN201811415619.3, 公开号CN111218479A)。 由于CRISPR系统对基因进行编辑的最关 键环节就是对目的DNA位点精准的切割, 因此CRISPR系统常被比作一把可定点切割DNA的 “魔剪”(参见文献:Mali,P.,Yang,L.,Esvelt,K.M.,Aach,J.,Guell,M.,DiCarlo,J.E., Norville,J.E.,and  Church,G.M.(2013).RNA ‑guided human genome engineering  via  Cas9.Science  339,823‑826)。 [0005]我们知道癌 症的放疗的基本原理是通过射线将D NA打断, 这些断裂的D NA不能被修 复时会激活包括凋 亡等多种死亡信号通路, 导致细胞死亡。 但由于放疗难以避免的也会造 成正常细胞的DNA损伤, 因此剂量和范围都受到严格控制, 不能完全清除癌细胞, 且副作用说 明 书 1/12 页 3 CN 115227834 A 3

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