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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210622773.8 (22)申请日 2022.06.02 (71)申请人 中山大学肿瘤防治中心(中山大 学 附属肿瘤医院、 中山大 学肿瘤研究 所) 地址 510060 广东省广州市越秀区东 风东 路651号中山大 学附属肿瘤医院 (72)发明人 李隽 宋立兵 余汝媛 李新城  张淑霞 胡雅梦  (74)专利代理 机构 广州嘉权专利商标事务所有 限公司 4 4205 专利代理师 蒋斌 (51)Int.Cl. C07K 14/47(2006.01) C12N 15/12(2006.01)C12N 15/85(2006.01) C12N 15/113(2010.01) C12N 5/10(2006.01) G01N 33/574(2006.01) G01N 33/68(2006.01) A61K 45/00(2006.01) A61K 31/282(2006.01) A61K 33/243(2019.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 DDUP作为肿瘤耐药检测、 治疗及预后分子靶 点的应用 (57)摘要 本发明属于生物技术和医学领域, 公开了 DDUP作为肿瘤耐药检测、 治疗及预后分子靶点的 应用。 该DDUP可以调控DNA损伤和/或DNA损伤修 复, 与肿瘤患者的铂类药物抵抗性、 复发、 总体生 存时间、 无病生存时间显著相关, 可作为肿瘤耐 药、 肿瘤预后、 肿瘤复发检测的标志 物。 权利要求书2页 说明书22页 序列表5页 附图6页 CN 114989286 A 2022.09.02 CN 114989286 A 1.一种DDUP, 所述D DUP的氨基酸序列包 含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。 2.与权利要求1所述的D DUP相关的生物材 料, 所述生物材料包含a1)~a4)中的任一种: a1)编码权利要求1所述的D DUP的核酸分子; a2)含有a1)所述核酸分子的表达盒; a3)含有a1)所述核酸分子的载体; a4)含有a1)所述核酸分子的细胞系。 3.检测DDUP的物质在制备肿瘤耐药检测产品、 肿瘤预后 检测产品或预测肿瘤复发检测 中的应用; 所述D DUP的氨基酸序列包 含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。 4.根据权利要求3所述的应用, 其特 征在于: 所述肿瘤耐药中的药包 含铂类药物。 5.DDUP抑制剂在制备提高肿瘤对铂类药物敏感性的产品中的应用; 所述DDUP的氨基酸 序列包含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。 6.根据权利要求5所述的应用, 其特 征在于: 所述DDUP抑制剂包含抑制DDUP活性的物质、 降解DDUP的物质、 降低DDUP表达水平的物 质中的至少一种; 优选地, 所述抑制DDUP活性的物质包含抑制DDUP磷酸化的物质; 进一步优选地, 所述抑 制DDUP活性的物质包 含ATR抑制剂; 优选地, 所述降低D DUP表达水平的物质包 含b1)~b3)中至少一种: b1)靶向D DUP的siRNA、 dsRNA、 miRNA、 核酶、 gRNA或shRNA; b2)编码b1)的核酸分子; b3)包含b2)的表达盒、 载体或转基因细胞系; 优选地, 所述靶向D DUP的shRNA的序列如SEQ  ID NO.3或SEQ  ID NO.4所示; 优选地, 所述靶向D DUP的gRNA的序列如SEQ  ID NO.5或SEQ  ID NO.6所示; 优选地, 所述靶向D DUP的siRNA的序列如SEQ  ID NO.21或SEQ  ID NO.22所示。 7.一种药物, 包 含: DDUP抑制剂;权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114989286 A 2所述DDUP抑制剂包含抑制DDUP活性的物质、 降解DDUP的物质、 降低DDUP表达水平的物 质中的至少一种; 所述DDUP的氨基酸序列包 含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。 8.根据权利要求7 所述的药物, 其特 征在于: 所述抑制DDUP活性的物质包含抑制DDUP磷酸化的物质; 进一步优选地, 所述抑制DDUP 活性的物质为ATR抑制剂; 优选地, 所述降低D DUP表达水平的物质包 含b1)~b3)中至少一种: b1)靶向D DUP的siRNA、 dsRNA、 miRNA、 核酶、 gRNA或shRNA; b2)编码b1)的核酸分子; b3)包含b2)的表达盒、 载体或转基因细胞系; 优选地, 所述靶向D DUP的shRNA的序列如SEQ  ID NO.3或SEQ  ID NO.4所示; 优选地, 所述靶向D DUP的gRNA的序列如SEQ  ID NO.5或SEQ  ID NO.6所示; 优选地, 所述靶向D DUP的siRNA的序列如SEQ  ID NO.21或SEQ  ID NO.22所示; 优选地, 所述药物还 包含铂类药物。 9.一种试剂盒, 包 含: 检测D DUP的物质; 所述D DUP的氨基酸序列包 含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。 10.ATR抑制剂在制备D DUP抑制剂中的应用, 所述D DUP的氨基酸序列包 含: a)MWLVECTGRDLTGLSCLLSMD RQPRRRQHVAGCRDVPPPLPQGSWGQTSP RHSILCSKSGCDLLGGGEYN GETSGEEFLAPAWTCRAQQAATWLSVQQTSHKALGPA GGAAMSSKLSPEEQFLSRIHFLRTFMCSVA GAELPGIPQ ATENGEGCRPARD PASSPSSLSMASVYTQCS SAQLVSALS(SEQ  ID NO.2); 或 b)与SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列具有95%、 96%、 97%、 98%或99%的序列同一性 的序列。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114989286 A 3

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